У Одсеку за интерну ревизију обављају се следећи послови:

• припрема предлога Повеље интерне ревизије;
• припрема и израда нацрта стратешког и годишњег плана интерне ревизије;
• прегледање и давање сагласности на коначан ревизорски извештај
• извештавање директора Управе кроз годишњи извештај о раду интерне ревизије, периодичне извештаје и извештаје о свакој извршеној интерној ревизији са свим важним налозима и датим препорукама, као и предузетим радњама за побољшање пословања; праћење спровођења препорука наведених у извештајима из претходно обављених ревизија;
• сарадња са Државном ревизорском институцијом, другим државним органима, међународним и домаћим институцијама и удружењима;
• обављање ревизије везане за систем управљања ИПА програмима и пројектима;
• припремање извештаја у вези рада Одсека;
• контролисање примене прописа у области финансијско-материјалног пословања у поступку претходне контроле;
• контролисање у поступку накнадне контроле наменског коришћења средстава буџета;
• припрема документације и сарађивање са руководиоцима организационе јединице код које се врши ревизија;
• израда извештаја о спроведеној ревизији;
• израда упутстава, приручника и планирање прегледа;
• састављање периодичних и годишњих извештаја;
• процена ризика и припрема програма ревизије;
• одређивање величине узорка и метода одабира узорака;
• обрада и документовање ревизорских налаза и препорука и праћење спровођења препорука наведених у извештајима из претходно обављених ревизија.